Fontanna usytuowana w najbardziej reprezentacyjnym punkcie miasta, w północno-zachodniej części Długiego Targu, na osi Dworu Artusa.
Ten symbol związku Gdańska z morzem stanął przed Dworem Artusa w 1633 roku staraniem ówczesnego burmistrza Bartłomieja Schachmanna. Rok później dodano żelazną kratę z herbami Gdańska i polskimi orłami. Autorem projektu całości fontanny był Abraham van den Blocke. Według jednej z gdańskich legend to właśnie Neptun przyczynił się do powstania słynnej gdańskiej nalewki – Goldwassera.
Z czasem Fontanna Neptuna stała się symbolem Gdańska; jej replika, obok Dworu Artusa i Pomnika Poległych Stoczniowców stanęła w Parku Mini-Europa w Brukseli. To miejsce, przy którym najczęściej fotografują się turyści.